遵循“加强基础，淡化专业，因材施教，分流培养”的方针，培养具备环境科学基础理论、知识和技能，能在科研机构、高等院校和企事业单位等从事科研、教学、环境保护和管理等工作的专门人才。设置区域环境过程研究与模拟、环境化学与毒理学、环境规划与管理等教学模块。每个模块根据培养目标设置相关课程，学制四年。除本学院开设课程外，模块中包括多门生物、化学、物理等相关院系开设的相关课程。员工可根据个人兴趣选择某一模块的课程，也可以跨模块选择课程。主要课程包括：环境科学概论，应用数理统计，环境经济学，定量分析及实验，生物化学及实验，仪器分析及实验，环境风险评价，环境风险管理，环境监测与实验等。